另一边，直系的长江三督江苏督军李纯、湖北督军王占元和江西督军陈光远也紧急举行会晤，要求停止湖南战事、撤回傅良佐、改组内阁、整顿倪嗣冲部，这等于是直系与皖系正式地针锋相对。直系所提出的前三个条件，完全是在呼应桂系，而最后一个条件则是出于自我考虑，倪嗣冲是皖系的主将，也是皖系中真正的实力派，更是段祺瑞放在长江三督头顶上的一把刀，在张勋复辟失败之后，倪嗣冲趁机收服了江苏北部徐州、海州一带的张勋旧部，更是增强了自己的实力。因此长江三督要求整顿倪嗣冲部。如今桂系和直系串通一气，皖系也就拉拢了奉系的张作霖，21日张作霖致电北京政府，催促其立即出兵讨伐两广。
不过，直系长江三督的激烈态度，让段祺瑞意识到事态日趋严重，只好把皖系大将卢永祥留在上海，以防备江苏、湖北和江西可能出现的意外状况，并且暂缓进攻西南的计划。因为长江三督的态度，使得皖系中一部分激进势力抬头，他们认为长江三督可能是得到了冯国璋的授意，而冯国璋则与陆荣廷来往密切，因此需要发动一次政变让冯国璋下台。于是从10月下旬开始，北京城里谣言四起，传说北京军人密谋发动“兵谏”软禁总统，冯国璋吓得惊慌失措，急忙在22日同意段祺瑞提出的褫夺刘建藩和林修梅的官职及勋章，并且予以通缉。27日，“兵谏”谣言愈演愈烈，冯国璋勉强下令罢免广东督军陈炳焜，派李耀汉兼署广东督军，莫擎宇会办广东军务，李福林接任广惠镇守使。