至此，噶尔丹发动的叛乱，历时8年，终于被彻底粉碎了。从此以后，清廷重新控制了阿尔泰山以东的漠北蒙古，并赐予当地蒙古贵族各种封号和官职；同时，清廷又在乌里雅苏台设立将军，以统辖漠北蒙古。
多子非福，立储也烦恼
历朝历代，权力的交接都是一件大事，也是一件让统治者头疼的事情。对最高权力的过分迷恋，会让有些人忘却自我、失去理智，甚至忘记父子、兄弟之间的情分。试想，如果统治者选错了继承人，这不仅会让祖宗蒙羞，更有可能危及到家族的统治。而玄烨能够在众多的儿子中，选出胤禛来做他的接班人，可谓是慧眼独具、睿智非凡。
玄烨一生有35个儿子，20个女儿。在他的诸多儿子中，长大成人者过半。二阿哥胤礽为孝诚仁皇后所生。在胤礽出生后没多久，其生母就因病离他而去，于是，玄烨格外关心和宠爱这个孩子，想要给这个孩子更多的关爱。康熙十四年（1675年），胤礽还未满两岁时，玄烨就立他为皇太子。随后，在玄烨的精心栽培下，这位皇太子能文能武，满汉文字兼通；他既熟知四书五经，又精通国语骑射。但让玄烨失望的是，胤礽却没有“心系天下，纯孝仁慈”的胸怀抱负。或许是因为母亲早逝，他的性格暴戾无常、骄纵蛮横，而且还结党营私。康熙四十二年（1703年），玄烨下令要杀索额图，索额图是胤礽生母的叔父，与胤礽交往甚密。也正是这个原因，玄烨父子关系变得更加紧张。在发现胤礽的种种劣迹后，玄烨气急败坏、忍无可忍，于康熙四十七年（1708年）九月初四，以胤礽“不法祖德，不遵朕训，惟肆恶虐众，暴戾淫乱”为理由，宣布废除他太子之位。之后，废储太子的事件如同一支火把，点燃了玄烨诸位皇子抢夺储位的战火。